蒙城县税务局，设11个内设机构（正股级）、11个派出机构（其中：副科级10个、正股级1个）、1个事业单位（正股级）。

（一）内设机构

1.办公室（党委办公室）。

2.法制股。

3.税政一股。

4.税政二股。

5.社会保险费和非税收入股。

6.收入核算股。

7.征收管理股。

8.税收风险管理股。

9.组织人事股。

10.税源管理股（2个）。

机关党委（党建工作股）。

根据有关规定，设置党委纪检组，名称为“中共国家税务总局蒙城县税务局委员会纪律检查组”。

（二）派出机构

1.第一税务分局（办税服务厅，副科级）。

2.第二税务分局（副科级）。

另设置8个税务分局、1个税务所，为办税服务和基础管理事项部门，分别是：城关税务分局（副科级）、岳坊税务分局（副科级）、双涧税务分局（副科级）、乐土税务分局（副科级）、板桥集税务分局（副科级）、小涧税务分局（副科级）、立仓税务分局（副科级）、经济开发区税务分局（副科级）、三义税务所（正股级）。

（三）事业单位

信息中心。